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| 結晶化したM結核タンパク質 | タンパク質は、体が正常に機能する上で必要なアミノ酸で構成される分子です。タンパク質の3D構造を分析することで生理作用を理解する手掛かりが得られ、有効な薬剤と治療薬の設計が楽になります。タンパク質構造を探求する主な方法は、結晶学を通すことです。結晶学では、タンパク質は数千もの実験を通して結晶になります。従来、これらの実験はそれぞれ人間の目でふるいにかけられタンパク質結晶を検出していました。
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| 微小タンパク質の結晶構造 | このプロセスを自動化するために、研究者は画像処理技術を使っています。Axygen Biosciencesは４メガピクセル画像に高速フーリエ変換(FFT)、相互相関、およびその他の非線形フィルタリングを利用する、高度な画像処理アルゴリズムを開発しました。このアルゴリズムは、プロセッサ速度の制限と高価な専用システムのために実装することが困難でした。これらの問題を解決するために、Axygen BiosciencesではNVIDIAの助けで処理時間を10倍高速にしました。強力なNVIDIA SLI™ Technology (DualおよびQuad)では1.7から3.5 xのアクセラレーションを追加で利用できるようにして、ほとんど同時の計算を行っています。
Axygen Bioscienceのドミニク・トッパニは次のようにコメントしています。「当社のNVIDIAベースのプラットフォームはタンパク質結晶イメージングに対する従来の生涯を取り除いている。分かりやすい開発ツールと相まったグラフィックスのフィールドにおけるNVIDIAの不断の刷新が、命令行を変更せずに高速な処理につながると確信している。強力なソリューションにより、研究室は効率的、かつ自動的にタンパク質結晶を見つけ、最終的には命を救うことができる目標薬剤を速やかに作り出すことができる」。
詳細については、www.axygenbio.com にアクセスしてください。
画像はローレンスリバーモア国立研究所、ブレント・シゲルク氏により提供により提供されました。 | 
